Taxonomia

 Nota: Para o conceito num sentido mais genérico, veja Taxonomia (geral).

Taxonomia (do grego antigo τάξις, táxis, "arranjo" e νομία, nomia, "método") é a disciplina biológica que define os grupos de organismos biológicos com base em características comuns e dá nomes a esses grupos. Para cada grupo, é dada uma nota. Os grupos podem ser agregados para formar um supergrupo de maior pontuação, criando uma classificação hierárquica. Os grupos criados por este processo são referidos como taxa (no singular, táxon). Um exemplo da classificação moderna foi publicado em 2009 pelo Angiosperm Phylogeny Group para todas as famílias de plantas com flores vivas (Sistema APG III).

Definições

A definição exata de "taxonomia" varia ligeiramente de fonte para fonte, mas o núcleo da disciplina permanece: a concepção, nomeação e classificação dos grupos de organismos. Nas referências, três definições são encontradas nos livros didáticos. Veja, abaixo:

• Teoria e prática de agrupamento de indivíduos em espécies, organizando as espécies em grupos maiores e dando os nomes aos grupos, produzindo assim uma classificação;
• Um campo da ciência (e principal componente da sistemática) que engloba identificação, descrição, nomenclatura e classificação;
• A ciência da classificação, em biologia, o arranjo dos organismos em uma classificação.

Aplicação

Taxonomia é uma subdisciplina de biologia e é praticada por biólogos conhecidos como taxonomistas, embora naturalistas entusiastas frequentemente se envolvem em publicações de novos taxa. O trabalho realizado pelos taxonomistas é crucial para a compreensão da biologia em geral. Dois campos de biologia aplicada em que o trabalho taxonômico é de fundamental importância são o estudo da biodiversidade e a conservação. Sem uma taxonomia dos organismos em uma determinada área, estimar a quantidade da diversidade presente não é realista. Como a conservação tornou-se cada vez mais politicamente importante, o trabalho taxonômico impacta não só na comunidade científica, mas na totalidade da sociedade.

Descrições taxonômicas

Espécie-tipo para a Nepenthes smilesii, uma típica planta carnívora.

O táxon é definido por sua descrição. Não existem regras fixas que regem a definição dos taxa, mas a nomeação e publicação de novos taxa é regido por um conjunto de regras. Em zoologia, a nomenclatura mais comumente utilizados (superfamília a subespécie), é regulada pelo Código Internacional de Nomenclatura Zoológica. Nas áreas de botânica, Ficologia e micologia, a nomeação dos taxa é regido pelo Código Internacional de Nomenclatura Botânica, dentre as características deste, por exemplo, estão o princípio de prioridade, desde 1842, e a associação do nome de um táxon ao tipo, aceita a partir de 1930.

A descrição inicial de um táxon envolve cinco requisitos principais:

• O táxon deve receber um nome com base nas 26 letras do alfabeto latino (um binômio das novas espécies ou uninomial para outros patentes);
• O nome deve ser único (não pode ter um homônimo);
• A descrição deve basear-se em pelo menos um Espécie-tipo;
• Ela deve incluir referências e atributos que tornem o táxon único;
• Estes quatro primeiros requisitos devem ser publicados em uma obra em que haja um grande número de cópias idênticas, como um registro científico permanente.
• Segundo o princípio de prioridade, o nome mais antigo validamente publicado prevalece no caso de sinônimos taxonômicos.

Muitas vezes também são incluídas mais informações, como a distribuição geográfica do táxon, notas ecológicas, química, comportamento etc. Os pesquisadores podem chegar a vários taxa, dependendo dos dados disponíveis e os recursos, os métodos variam de simples comparações quantitativa ou qualitativa de características marcantes, análises com computadores das grandes quantidades de dados de sequência de DNA.

Classificação dos organismos

A classificação biológica é um passo crítico no processo taxonômico, pois informa hipoteticamente quais são os parentes do taxon. O nome de um táxon funciona como um código de acesso direto à sua literatura, ou seja, às informações já encontradas a respeito deste, exigindo estabilidade. Embora a disciplina de taxonomia em si não lide com as investigações de como os taxa estão relacionados uns com os outros, ela serve para comunicar estes resultados. Para isso, ela classifica em ordens taxonômicas criadas por Carl Von Linné, conhecido como Lineu (em ordem do maior para o menor): Domínio, Reino, Filo, Classe, Ordem, Família, Gênero e Espécie.

Filogenética

Ver artigo principal: Filogenética

Filogenia é a história genealógica de um grupo de organismos e uma representação hipotética das relações ancestral/descendente e filogenética (cladística) é o ramo da sistemática interessado na reconstrução da filogenia. O sistema de classificação biológica permanece praticamente inalterado em sua estrutura desde 1753. Mas, a maneira como as relações entre estes táxons são investigadas mudou drasticamente nas últimas décadas. Agora, é comum os biólogos elaborarem a classificação com base nos resultados de análises filogenéticas usando dados de sequência de DNA. Como resultado, a filogenética tem impacto direto sobre as classificações taxonômicas, mesmo que não seja parte da taxonomia. Atualmente a filogenética passou a ser considerada fundamental para a moderna sistemática, embora sua utilização para a descrição de novos táxons e para o posicionamento dentro de um esquema de classificação existente não seja obrigatória. Desde seu advento, os taxonomistas estão empenhados em revisar as propostas de classificações preexistentes de modo a atender a filogenia. Frequentemente relações insuspeitas entre seres ou grupos de seres são descobertas conduzindo a grandes revisões nas classificações. Tem sido muito útil também para esclarecer o mais correto posicionamento de espécies e gêneros cuja morfologia tornava difícil uma decisão sobre sua melhor classificação.

Taxonomia numérica

Em taxonomia numérica, a taxonomia é exclusivamente com base na análise de Clustering e "união de vizinho" para melhor ajustar as equações numéricas que caracterizam traços mensuráveis ​​de uma série de organismos. É o resultado de uma medida de "distância" evolutiva entre as espécies. O uso deste método tornou-se raro nos tempos modernos, tendo sido em grande parte substituída pela análises cladísticas, pois a taxonomia numérica é sensível a serem enganados por traços de Plesiomorfia.

História da taxonomia

Primeiros taxonomistas

A taxonomia tem sido chamada de "profissão mais antiga do mundo", pois nomear e classificar nossos arredores foi provavelmente uma das primeiras coisas que a humanidade fez para poder se comunicar. Foram importantes para saber os nomes das plantas e animais venenosos e comestíveis, e para comunicar essas informações para os outros membros da família ou grupo.

No Oriente, um dos primeiros registros de farmacopeias foi escrito por Shennong, imperador da China (c. 3000 a.C.). Ele queria divulgar informa��es relacionadas com a agricultura e medicina, e diz-se ter provado centenas de plantas com o objetivo de aprender o seu valor medicinal. Registros s�o dif�ceis de interpretar depois de algum tempo, mas ilustra��es de plantas medicinais aparecem em pinturas eg�pcias de c. 1500 a.C.. As pinturas mostram claramente que essas sociedades valorizavam e comunicavam o uso de diferentes esp�cies e tinham uma taxonomia b�sica.

De Arist�teles at� Pl�nio

Registros hist�ricos mostram que a classifica��o dos organismos informalmente ocorreu nos tempos de Arist�teles (Gr�cia, 384-322 a.C.), que foi o primeiro a come�ar a classificar todas as coisas vivas. Alguns termos que ele deu para os animais, como os invertebrados e vertebrados ainda s�o comumente usados. Seu aluno Teofrasto (Gr�cia, 370-285 a.C.) continuou esta tradi��o e escreveu uma classifica��o de 480 plantas chamado Historia Plantarum. V�rios grupos de plantas reconhecidas atualmente ainda pode ser rastreada at� Teofrasto, como Cornus, A�afr�o e Narciso. O pr�ximo grande ressurgimento de taxonomistas chegou com Pl�nio, o Velho (Roma, 23-79 d.C.). Elaborou 160 volumes do trabalho Naturalis Historia, descreveu muitas plantas e deu muitos nomes latinos com nomenclatura binomial.

Taxonomistas Pr�-Linnaeus

P�gina de t�tulo do Systema Naturae, Leiden, 1735

S� 1 500 anos depois, as obras taxon�micas se tornaram suficientemente ambiciosas para substituir os textos antigos. Isso � muitas vezes creditado ao desenvolvimento das sofisticadas lentes �pticas, o que permitiu o estudo da morfologia dos organismos com muito mais detalhes. Um dos primeiros autores a tirar vantagem deste salto tecnol�gico foi Andrea Cesalpino (It�lia, 1519-1603), que � muitas vezes � referido como "o primeiro taxonomista". Sua grande obra De Plantis saiu em 1583 e descreveu mais de 1 500 esp�cies de plantas. Duas grandes fam�lias de plantas que ele primeiro reconheceu ainda est�o em uso hoje: o Asteraceae e Brassicaceae. Em seguida, no s�culo XVII, John Ray (Inglaterra, 1627-1705) escreveu muitas obras taxon�micas importantes. Indiscutivelmente a sua maior realiza��o foi Methodus Plantarum Nova (1682), onde publicou mais de 18 000 esp�cies de plantas. Na �poca, suas classifica��es foram a mais complexa produzida por um taxonomista, pois ele baseou seus t�xons em muitos caracteres combinados. Os pr�ximos trabalhos taxon�micos importantes foram produzidos por Joseph Pitton de Tournefort (Fran�a, 1656-1708). Seu trabalho a partir de 1700, Institutiones Rei Herbariae, incluiu mais de 9 000 esp�cies em 698 g�neros. Isso influenciou diretamente Carl Linnaeus, pois foi o texto que este usou quando era um jovem estudante.

A era Linnaeus

Classificar � uma atividade intr�nseca ao racioc�nio humano, mas a classifica��o biol�gica tomou fei��es modernas apenas a partir do sistema hier�rquico-binomial implantado por Lineu em 1753. O bot�nico sueco Carl Linnaeus (1707-1778) marcou o in�cio de uma nova era na taxonomia. Com suas principais obras Systema Naturae (primeira edi��o) em 1735, Species Plantarum em 1753, e Systema Naturae (Edi��o 10), ele revolucionou a taxonomia moderna. Suas obras implementaram um sistema de nomenclatura binomial padronizado para esp�cies animais e vegetais, o que provou ser uma solu��o elegante para uma literatura taxon�mica ca�tica e desorganizada. O sistema de Linnaeus nasceu e ainda hoje � usado essencialmente da mesma maneira que no s�culo XVIII. Inicialmente, com base no modo de vida, dire��o da evolu��o e tipo da organiza��o de seu corpo, os seres vivos foram divididos em dois grandes reinos: Animal e Vegetal. Mais tarde, como o desenvolvimento do microsc�pio, entre outras t�cnicas, tornou-se �bvio que muitos organismos n�o se encaixavam em nenhum desses reinos, por exemplo, as bact�rias. Atualmente, os taxonomistas de plantas e animais consideram o trabalho de Linnaeus como o "ponto de partida" para nomes v�lidos (em 1753 e 1758, respectivamente). Os nomes publicados antes destas datas s�o referidos como "pr�-Linnaeus" e n�o s�o considerados v�lidos (com a exce��o das aranhas, publicadas na obra Svenska Spindlar). At� mesmo nomes taxon�micos publicados por Carl Linnaeus antes destas datas s�o consideradas pr�-Linnaeus.

Nomes v�lidos x nomes aceitos

Como visto acima, existem regras claras para a publica��o de novas esp�cies, g�neros, etc.. Quando um novo nome � publicado e atende a todas as regras, � um nome v�lido, ou seja, validamente publicado. No entanto isto n�o implica que seja um nome automaticamente aceito. A n�o aceita��o de um nome pode acontecer e � bastante frequente. Na realidade, apesar de desconhecermos uma estat�stica oficial, provavelmente mais da metade dos nomes v�lidos n�o s�o considerados aceitos e h� muitos casos em que n�o h� consenso sobre o nome aceito. Isto ocorre por diversas raz�es.

Naturalmente, quando as atuais regras taxon�micas come�aram a ser utilizadas, as comunica��es eram bastante demoradas. Uma �poca muito diferente de hoje em que algu�m publica uma nova esp�cie e em poucos minutos esta informa��o pode ser inclu�da nos grandes bancos de dados da internet. Naquela �poca, meses ou mesmo anos se passavam antes que fosse poss�vel saber se alguma esp�cie j� havia sido publicada por algu�m em outra parte do mundo. Deste modo muitas esp�cies foram descritas diversas vezes com nomes diferentes. Pelas regras, vale apenas o nome mais antigo, o primeiro a ser publicado, e os posteriores s�o considerados sin�nimos, ou seja, desde que atendam as regras, todos os nomes s�o v�lidos, mas apenas o mais antigo � aceito.

Outro caso bastante frequente resulta de altera��es na classifica��o de esp�cies pelos g�neros. Obviamente, quando o sistema de classifica��o foi concebido n�o foram descritos de imediato todos os g�neros conhecidos hoje. Por exemplo, Linnaeus descreveu apenas oito g�neros de orqu�deas. Inicialmente, todas as orqu�deas conhecidas eram classificadas em um desses oito g�neros. Hoje, h� cerca de mil g�neros de orqu�deas, de modo que a maioria foi reclassificada em novo g�nero e o nome mais antigo passou a n�o ser aceito mais.

Taxonomias n�o biol�gicas

Quase todos objetos animados, objetos inanimados, lugares, conceitos, eventos, propriedades e relacionamentos, podem ser classificados de acordo com algum esquema taxon�mico. Taxonomias dos tipos de coisas gen�ricas resultam da investiga��es filos�fica. Come�ando com a obra de Arist�teles, onde h� v�rias "Categorias" de fil�sofos, dispostos em Categorias gen�ricas (tamb�m chamados de tipos ou classes) em uma hierarquia que mais ou menos satisfaz os crit�rios para ser uma taxonomia.

Taxonomia, ou categoriza��o, na cogni��o humana tem sido uma importante �rea de pesquisa em psicologia. Os psic�logos sociais t�m procurado modelar a maneira pela qual a mente humana categoriza est�mulos sociais (a teoria da autocategoriza��o � um exemplo protot�pico). Alguns afirmam que a mente humana adulta organiza naturalmente seu conhecimento do mundo em tais sistemas. Os antrop�logos t�m observado que as taxonomias s�o inerentes a sistemas locais culturais e sociais, servindo a v�rias fun��es sociais.

Taxonomias, tais como as analisadas por �mile Durkheim e Claude L�vi-Strauss, s�o �s vezes chamadas taxonomias populares para distingui-las das taxonomias cient�ficas. Baraminologia � uma taxonomia usada no criacionismo cient�fico, que na classifica��o dos t�xons se assemelha �s taxonomias populares. A express�o "taxonomia empresa" � usado em neg�cios para descrever uma forma muito limitada de taxonomia usada apenas dentro de uma organiza��o. Um exemplo seria um certo m�todo de classifica��o de �rvores como "Tipo A", "Tipo B" e "Tipo C" utilizado apenas por uma empresa madeireira para categorizar os embarques. Os militares e os campos de saúde e segurança também têm suas próprias taxonomias. No campo da computação moderna, a web semântica requer formais taxonomias de extensão XML (como XBRL) chamados namespaces.

Ver também

• Sistemática
• Categorização
• Folksonomia
• Classificação científica
• Taxonomia dos objectivos educacionais
• Taxonomia dos seres vivos
• Arquitetura de dados
• Modelagem de dados

Ligações externas

• Commons
• Wikilivros
• Wikcionário

Ferramentas taxonômicas

• Biodiversity Heritage Library – Literatura sobre biodiversidade disponível abertamente para o mundo;
• BOLD SYSTEMS – The Barcode of Life Data Systems com biblioteca de código de barras de DNA, taxonomia, identificação, bancada de trabalho e outros recursos;
• Catalogue of Life – O banco de dados online das espécies conhecidas mundialmente de animais, plantas, fungos e microorganismos;
• DISCOVER LIFE – Ferramentas para estudar a história natural e rastrear o impacto das mudanças climáticas, espécies invasoras e outros fatores ecológicos em grande escala;
• Encyclopedia of Life – Acesso global ao conhecimento sobre a vida na Terra;
• ESABII – Manuais de Treinamento em Taxonomia e folhas de identificação de espécies para o Leste e Sudeste Asiático;
• Global Biodiversity Information Facility – Ocorrências globais de espécies e coleções de espécimes;
• Tropicos – Bancos de dados do Jardim Botânico de Misouri
• NCBI Taxonomy Browser – Conhecimento filogenético e taxonômico de uma variedade de fontes, incluindo a literatura publicada, bancos de dados baseados na web e o conselho de remetentes de sequência para e especialistas em taxonomia externos
• Online Taxonomic Key Application – Royal BC Museum, Canadá
• Artportalen.se – Portal de Espécies Suecas
• ID guides for marine organisms – A rede de informações sobre a vida marinha
• Lucidcentral – Lucid Ferramentas de Identificação e Diagnóstico
• EDIT platform for cybertaxonomy – Plataforma EDIT para cibertaxonomia
• WORMS – O registro mundial de espécies marinhas